五氟磺草胺能被土壤迅速吸附。在大多数稻田的土壤中淋溶性较弱。其在粘质土及含高有机质的土壤中的吸附量高于轻质土及低有机质含量的土壤。在ph>8.0的土壤中其具有加重药害的危险性。该药剂在土壤中易移行，且非长期滞留。由于该药剂的饱和蒸气压较低，故不易从水中蒸散；在灌水的稻田中，药剂的半衰期为2~13d；光解与微生物降解为五氟磺草胺的主要消失途径。它能在水中抗水解，但在浅水层经光解可迅速消失，该水溶液的光解为三种途径：磺酰胺桥裂解，三唑嘧啶及其取代基逐步降解，磺酰基光氧化。此光解产物可长期残留。在稻田土壤中，厌气微生物降解是药剂消失的重要过程，其消失速度和光解一样迅速。